【土地资源】土地面积124095.2公顷，其中，耕地6355.42公顷，占总面积的5.12％；园地785.03公顷，占0.63％；林地109933.68公顷，占88.59％；城镇村及工矿地3197.18公顷，占2.58%；交通运输用地578.54公顷，占0.47%；水域及水利设施用地1662.79公顷，占1.34%；其他土地798.14公顷，占0.64％。

　　【水资源】全县有42条大小河流和260多条山溪，其中集雨面积100平方千米以上的河流有三江河、寨岗河、太保河、称架河、大龙河、凤岗河、庙公坑河7条。全县河流中，三江河、寨岗河是主要干河，对全县工农业生产具有举足轻重的影响。

　　【森林资源】连南林业用地面积106599.26公顷，其中商品林林地面积55035.74公顷，占51.62%；生态公益林林地面积51563.51公顷，占48.37%。林业用地中，乔木林总蓄积8331152立方米，其中：杉木5225587立方米，占62.72%；马尾松266094立方米，占3.19%；湿地松51024立方米，占0.61%；桉树67886立方米，占0.81%；速生相思244立方米，占0.002%；其它软阔314149立方米，占3.77%；黎蒴3915立方米，占0.005%；其它硬阔1457723立方米，占17.50%；针叶混252463立方米，占3.03%；针阔混410631立方米，占4.93%；阔叶混278405立方米，占3.34%；其它木本果树3031立方米，占0.003%。

　　【矿产资源】截至目前，连南共发现矿产18种，经初步地质工作评价的13种，矿产地40处，其中能源矿产4处，金属矿产29处，非金属矿产5处，地下水矿产2处（见资源分布图）。矿床规模达中大型的3处，其中大型的2处。矿产资源主要特点是：矿产种类不多，集中度相对较大，大中型矿产地占比例较少，金属矿产中的铁矿，非金属矿产中水泥用灰岩和大理岩为本县优势矿产，资源储量相对较为丰富。目前连南持证矿山共有4座，其中3座是金属矿，1座非金属矿。

　　【动物资源】连南地处粤北山区，陆生动物资源丰富，主要分布在板洞省级自然保护区。根据2021年保护区科学考察和红外相机监测结果，区内记录到陆生野生脊椎动物357种，其中国家一级重点保护有小灵猫、黄腹角雉、黄胸鹀等，国家二级重点保护动物有猕猴、豹猫、斑林狸、白眉山鹧鸪、白鹇、黑冠鹃隼、蛇雕、小鸦鹃、东方草鸮、领角鸮、短耳鸮、蓝喉蜂虎、白胸翡翠、红嘴相思鸟、白喉林鹟、仙八色鸫、画眉、平胸龟、地龟、三线闭壳龟、眼镜王蛇、三索锦蛇、虎纹蛙、细痣疣螈等56种。

　　【植物资源】连南地处粤北山区，多样的生境和适宜的气候条件孕育了丰富的植物资源。在板洞省级自然保护区，森林植被保存完好，种类多样，具有常绿阔叶林、落叶阔叶林、阔叶混交林、针叶林、针阔混交林、竹林、常绿落叶灌丛和灌草丛等植被类型。野生维管植物有1533种，其中一级重点保护植物1种（南方红豆杉），二级重点保护植物有蛇足石杉、福建观音座莲、金毛狗、桫椤、广东松、福建柏、百日青、穗花杉、厚朴、短萼黄连、六角莲、八角莲、大叶茶、肥荚红豆、花榈木、茸荚红豆、木荚红豆、伞花木、伯乐树、条叶猕猴桃、金柑（山桔）、黄檗、竹节参、七叶一枝花、金线兰、白及、建兰、墨兰、美花石斛、细茎石斛（广东石斛）和独蒜兰等31种，广东省级重点保护野生植物有穗花杉、沉水樟、短萼黄连、走马胎和银钟花等5种。